Sekretariat DPRK Manokwari adalah unit pendukung Dewan Perwakilan Rakyat Kabupaten Manokwari yang bertugas memberikan layanan administratif, keuangan, dan teknis. Fungsinya mencakup pengelolaan rapat, dokumentasi, komunikasi dengan pemerintah daerah, serta penyusunan program kerja dan anggaran sesuai peraturan.